二代转录组去除批次效应

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进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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绵羊转录组测序后差异表达基因太多了

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关于GO分析的问题

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R进行GO时出现No gene can be mapped....

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请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

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请问什么是基因组共线性分析？有什么意义？

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我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值

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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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问 KEGG结果为空？

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问 为什么我在做go的时候，用clusterProfiler富集没有结果，但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢？代码如图

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问 无参基因组分析GO富集到了这一步不会做

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问 SOAPdenovo-Trans 组装的 contig 如何获得 gene_trans_map

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问 在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的

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问 R进行GO时出现No gene can be mapped....

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