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【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点？

甲基化预测

看了很多文献，大都是采用计算的方法对DNA甲基化进行预测，我想知道，是否存在一个简便的工具，例如，对于玉米来说，是否存在一个数据库，可以通过上传基因ID，来自动判断这个基因上是否存在甲基化、磷酸化或其他表观修饰的潜在位点。

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-29 16:13

现在DNA甲基化最常用的办法是BS-Seq，直接就能测出来哪里是5mC。人和小鼠的都有数据库，我刚才搜了搜玉米也有很多BS-Seq的数据，但是数据库没有搜到。你可以下载一下他们的公共数据，然后来查询你说的某个gene位点是否有甲基化。至于其他修饰，如果有好的修饰测序技术，当然就有数据，没有合适的技术就暂时木有数据了。当数据积累到一定程度的时候，就可以做数据库咯~ 以上。

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: 徐寅生 初级会员
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发布时间: 2018-08-29 15:49

更新时间: 2018-08-29 16:13

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