2
关注
2372
浏览

sambamba使用

查看全部 1 个回答

chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-09-21 14:27
sambamba是一个用于处理BAM文件的工具,它可以进行排序、索引、过滤、统计和处理比对信息等操作。要使用sambamba提取LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中LITCHI017845的比对情况,你可以使用以下命令: ```bash sambamba view -f bam -F "qname == 'LITCHI017845'" LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam > LITCHI017845.bam ``` 这个命令将根据qname(即reads的名称)筛选出qname为'LITCHI017845'的比对记录,并将结果保存到LITCHI017845.bam文件中。 希望这个回答对你有帮助!

问题动态

发布时间
2023-09-21 14:18
更新时间
2023-09-21 14:27
关注人数
2 人关注

推荐内容

关于基因间的相关性分析
riboseq中frame指的是什么,是如何确定的,通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框
如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号
怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点
如何筛选小鼠lncRNA?
生存分析KM-plot问题
关于几个数据库对GO注释的疑问
翻译序列
请问在不考虑测序质量的情况下,如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基?
考研生物信息学院校推荐
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025