2
关注
1781
浏览

sambamba使用

查看全部 1 个回答

chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-09-21 14:27
sambamba是一个用于处理BAM文件的工具,它可以进行排序、索引、过滤、统计和处理比对信息等操作。要使用sambamba提取LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中LITCHI017845的比对情况,你可以使用以下命令: ```bash sambamba view -f bam -F "qname == 'LITCHI017845'" LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam > LITCHI017845.bam ``` 这个命令将根据qname(即reads的名称)筛选出qname为'LITCHI017845'的比对记录,并将结果保存到LITCHI017845.bam文件中。 希望这个回答对你有帮助!

问题动态

发布时间
2023-09-21 14:18
更新时间
2023-09-21 14:27
关注人数
2 人关注

相关问题

推荐内容

生存分析KM-plot交叉问题
请问在不考虑测序质量的情况下,如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基?
根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息,比如具体的位置?
基因本体论分析上下调基因差异
生存分析KM-plot问题
riboseq中frame指的是什么,是如何确定的,通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框
根据已知序列查找其第三代基因组编号
在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读
infercnv运行报错
smORF的鉴定方法
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025