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常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？

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如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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从多个.fa文件中提取以“poptri.”开头的蛋白序列

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