进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？

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原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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普通转录组的跨物种分析

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我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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二代转录组去除批次效应

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麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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转录本坐标转换成基因组坐标

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 基因表达

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问 肿瘤亚型分析

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问 转录组

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 ciriRNA表达量如何计算？（更）

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问 不同比对软件出的结果能进行比较吗？

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问 Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选

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问 如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?

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