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细菌的参考基因组下载

我想下载E.coli的参考基因组，但是在ucsc和ensembl上似乎都找不到，请问我可以在哪里下载到E.coli的参考基因组呢？感谢孟叔和网友们的解答

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1 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: 北京市
2023-06-06 08:39

您好！针对您的问题，您可以在NCBI网站上下载E.coli的参考基因组。具体步骤如下：

进入NCBI网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）。
在网站搜索框中输入“Escherichia coli”，然后点击搜索按钮。
在搜索结果页面中，选择“Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655”（或其他您需要的参考菌株），进入该菌株的信息页面。
在信息页面中，选择“NCBI Reference Sequence: NC_000913.3”（或其他您需要的参考序列），进入该序列的页面。
在该序列页面中，选择“Send to” -> “Complete Record” -> “File” -> “FASTA” -> “Create File”。
下载生成的FASTA文件，即可获得E.coli的参考基因组。

希望我的回答能够帮到您！如有疑问，欢迎继续提问。

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发布时间: 2023-06-06 08:29

更新时间: 2023-06-06 11:56

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