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徐寅生
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徐寅生
在 2018-10-03 14:55 发起了提问
旅游攻略
问答
如何在西宁附近旅游三天
Kevin_Lyu
:
大概这里还没有西宁的小伙伴看到吧 ( ̄. ̄)+
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徐寅生
在 2018-09-17 14:34 发起了提问
WGCNA
问答
[求助]WGCNA具体参数
请教大家一个问题。WGCNA 里面的数据导出来之后 有一个 weight这个变量是什么意思?
:
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徐寅生
在 2018-09-15 14:46 发起了提问
WGCNA
问答
[求助]WGCNA
孟浩巍
:
我简单理解一下你这个问题,你这个问题的是在问,怎么提取blue颜色对应的所有gene对吧? 如果我的理解没有错,那么最后你分析完以后有一个vector是存储了每个gene对应什么颜色,这个vector的长度应该和你的gene list是相同长度的,直接提取即可。
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徐寅生
在 2018-09-09 10:54 发起了提问
生信分析
问答
【求助】怎么能画出子网络图
我用cytoscape MCODE分析之后 软件没有把子网络图画出来,但是已经分析了结果。 那么,我怎么画出子网络? [attach]170[/attach] 已经解决了 问了一个白痴问题。原来是结果是有一颗 show的选项,点了才能显示
:
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徐寅生
在 2018-09-07 19:04 发起了提问
生信入门
问答
基因互作网络和蛋白互作网络
YDX
:
string
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徐寅生
在 2018-09-04 22:33 发起了提问
生信入门
问答
【求助】差异表达和特异表达
孟浩巍
:
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2018-09-05 修改 我现在明白你的意思了,就是你在没有ctrl的情况下怎么进行分析。 首先呢,...
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徐寅生
在 2018-09-02 10:44 发起了提问
生信入门
问答
【求助】如何确定时期特定表达基因
孟浩巍
:
1. 如果想要确定,每个时期特定的差异表达基因,这个要做每个case对每个case的差异表达检验。这样就能求出每个不同处理对于ctrl的差异表达gene list; 2. 对这些gene list进行进一步的分析,看看不同gene的在不同时期的表达特点。 3. 还可以做个pca,然后看pca...
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徐寅生
在 2018-08-29 15:49 发起了提问
甲基化预测
问答
【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点?
孟浩巍
:
现在DNA甲基化最常用的办法是BS-Seq,直接就能测出来哪里是5mC。 人和小鼠的都有数据库,我刚才搜了搜玉米也有很多BS-Seq的数据,但是数据库没有搜到。 你可以下载一下他们的公共数据,然后来查询你说的某个gene位点是否有甲基化。 至于其他修饰,如果有好的修饰测序技术,当然就有数据,没有...
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徐寅生
在 2018-08-26 17:22 发起了提问
linux网络配置
问答
【求助】在Ubuntu如何上网
zer0
:
检查你的host文件。
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徐寅生
在 2018-08-23 22:40 发起了提问
生信入门
Gene ID转换
问答
【求助】如何确定一种基因ID的类型
孟浩巍
:
这个没有太好的办法,就是凭经验。比如你写的,第一种就特别像玉米的gene id,第二种就是RefSeq,第三种不清楚。 我觉得这不是一个特别费心思的事情,首先做一个方向,常见的几种形式需要知道和熟悉,比如ensembl,比如refseq,比如ucsc。其次,看到不熟悉的gene id形式直接就go...
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