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先把生信坑能做够10年！

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孟浩巍在 2023-05-19 20:12 回答了问题 表观遗传学: cut tag 测序相关问题; 孟浩巍: 先回答你第2个问题，fastqc里的所谓重复不影响你做分析，那个的评估不准确。然后是unique mapping的比例，只要你看到目标区域有富集峰，那就继续分析即可。不是说一定要完美的建库结果，才能分析出有生物学意义和价值的东西。; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-19 20:10 回答了问题 bam: 从bam文件还能提取出来原来比对前的fastaq文件吗？; 孟浩巍: 就是BAM文件转fastq是可能的，但是就怕你这个BAM是经过过滤的，然后转出来的fastq文件是个原始输入文件的子集。; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-18 14:35 回答了问题 WGCNA: WGCNA; 孟浩巍: 1. 从h图看，好像分模块问题不是很大。 2. 选择6， 7， 8我感觉都差不多； 3. 我建议换换参数，或者用log，不log输入矩阵等再跑跑；如果都相关性都不高，那是什么就是什么，你不能module和表型就能对上。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-18 14:32 回答了问题 数据库: CMAP LINCS 2020下载问题; 孟浩巍: 为啥我直接就能下载，我也没注册……; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 3 回复

孟浩巍在 2023-05-18 11:21 回答了问题 测序序列: T to T测序中ONT测序起到的作用; 孟浩巍: 你说的这两个都有用。测DNA是为了拼基因组，测RNA就可以辅助基因的注释。; 赞同0 反对 0 人感谢 6 评论 2 回复

匿名用户在 2023-05-17 14:49 回答了问题 单细胞RNA_seq: 单细胞RNA-seq分析流程; 孟浩巍: 恐怖的chatGPT; 赞同3 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-17 14:46 回答了问题 RNA_seq: 用atac-seq数据计算的TSS enrichment score; 孟浩巍: ChatGPT回答得挺好……; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

匿名用户在 2023-05-17 11:40 回答了问题 生信问题: 染色体号是罗马数字怎么写sh循环; 孟浩巍: 类似 for chr_name in chrI chrII chrIII chrIV do xxx done; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍在 2023-05-17 11:36 回答了问题 问题求解: 分析CRISPR 高通量筛选数据; 孟浩巍: 这种报错信息量比较小，看不出什么具体的问题。; 赞同0 反对 1 人感谢 1 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-05-17 09:47 发起了提问 测试 生信分析思路 表观遗传学: 问答表观遗传学的常用技术和研究策略都有哪些？

chatGPT机器人: 表观遗传学是研究基因组中非编码区域对基因表达和细胞分化等生物学现象的影响的学科。常用的表观遗传学技术包括：甲基化测序技术：通过测序分析DNA甲基化水平的变化，了解基因调控和表观遗传修饰的机制。组蛋白修饰测序技术：通过测定组蛋白修饰的分布情况，了解基因表达调控和细胞分化的机制。 RNA测...; 关注问题 2  0  0 评论

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