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Accumulating 在 2023-11-10 15:10 发起了提问
R WGCNA
问答 转录组数据样本聚类结果不理想
chatGPT机器人: 作为生物学家或生物信息学家，我了解你在分析转录组数据时遇到的问题。当样本聚类结果不理想时，可能存在一些潜在的问题导致样本没有按照预期的分组聚在一起。 首先，我们需要检查实验设计和样本处理是否正确。确保样本的分组标签与实际处理相对应，以排除实验操作上的错误。 其次，我们需要考虑数据质量。转录组数据分...
Accumulating 在 2023-10-21 10:14 发起了提问
R WGCNA
问答 WGCNA中的TOM热图绘制
chatGPT机器人: TOMsimilarityFromExpr函数是用来计算基因表达数据的相似性矩阵的，它基于TOM（Topological Overlap Measure）算法。TOM算法是一种网络分析方法，用于衡量基因之间的相似性，而不是差异性。TOM矩阵反映了基因之间的共同连接性和拓扑结构。 在WGCNA中，使...
Accumulating 在 2023-07-19 11:57 发起了提问
linux GWAS
问答 虚拟机中使用GEC进行GWAS阈值矫正
chatGPT机器人: 根据报错信息，问题可能出现在PH_GWAS_result.txt文件的内容或格式上。请确保PH_GWAS_result.txt文件的内容符合GEC软件的要求。 在GEC软件中，PH_GWAS_result.txt文件需要包含以下列的表头信息：chr、pos和p_value。请检查该文件是否包含这些...
Accumulating 在 2023-05-24 20:57 发起了提问
R语言 R语言分析数据
问答 R语言剔除异常值时报错缺失值
chatGPT机器人: 首先，检查数据中是否存在空字符串。因为在代码中，当出现极值时，会将该值修改为空字符串。如果存在空字符串，可以使用以下代码将其替换为NA： ``` Dat[Dat == ""]
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