孟浩巍 回复了问题 2018-10-07 10:32

环境变量

问答 linux环境变量错误导致无法运行命令

孟浩巍: 把/bin  /usr/bin 等目录添加到PATH环境里面就好了。   [code]echo "export PATH=/bin:$PATH" >> ~/.bashrc echo "export PATH=/usr/bin:$PATH" >> ~/.bashrc source ~/.ba...

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刘正 发起了提问 2018-10-04 10:21

重测序

问答 求重测序不同群体示例数据

求重测序不同群体示例数据，什么物种，什么性状都可以，就是想学习下整个流程:

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Kevin_Lyu 回复了问题 2018-10-03 16:37

生信具体问题

问答 蛋白保守序列分析

Kevin_Lyu: TBtools应该可以满足你的需求，作者也有写一个基因家族分析的教程：https://mp.weixin.qq.com/s/-ZEQ7_2i4ozUjpVDmMfkAg

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Czc 回复了问题 2018-10-03 14:02

数据库

问答 SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答

Czc: 233333，，好像自己在生信技能树上找到了答案 [url]http://www.biotrainee.com/thread-800-1-2.html[/url] [size=14]跟GEO类似.[/size] [size=14]NCBI的SRA（Sequence ReadArchive）数据库是抓...

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stallworth 回复了问题 2018-10-02 15:32

生物信息学 生信入门 如何入坑

问答 生信到底如何入门？？？

stallworth: 进了实验室逼自己一把就入门了

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Holly 发起了提问 2018-10-01 18:22

NETWORK4.6

问答 NETWORK4.6

有结果文件，怎么通过这个软件改各个基因的名字:

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minipeach 发起了提问 2018-09-30 13:32

生信入门 生信问题 生信分析

问答 关于生存分析的问题

[attach]289[/attach] 我想知道这样的表格是怎么制作的，展示的这张是一篇文献中的表，他是自己提取TCGA的clinical中的信息做的还是有其他的什么软件或者包之类的？:

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孟浩巍 回复了问题 2018-09-30 10:45

生物信息学 生信问题

问答 关于GO分析的问题

孟浩巍: 可以，但是有可能注释不全。

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pagu 回复了问题 2018-09-29 00:35

shell脚本学习

问答 编写shell脚本的if循环如下，结果运行的时候出现如下报错？原因是什么？ 大家学习shell变程的时候推荐哪些视频教程呢

pagu: shell里边的if控制结构，条件是用中括号 [  ] 框起来的，我改了一下可以运行： [code]num1=100 num2=200 if [ ${num1} > ${num2} ] then echo "this ${num1} is great!" else echo "thi...

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俄二十 回复了问题 2018-09-28 22:27

问题求解 GATK

问答 利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事

俄二十: 加了还是不行，这次貌似是另外一种错误

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笨阿牛 回复了问题 2018-09-28 09:53

生信入门

问答 想补充生信统计学知识

笨阿牛: 这个问题太好了

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笨阿牛 回复了问题 2018-09-27 17:10

conda 安装deeptools conda

问答 请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？

笨阿牛: 自问自答吧！ [size=14]conda clean --packages[/size] [size=14]输入上面的命令之后，再安装，居然就好了！完全摸不着头脑[/size]

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i_thinking 回复了问题 2018-09-26 09:47

DESe2

问答 关于DESeq2样本聚类的问题

i_thinking: 请问是同一批数据吗？有没有做过标准化？

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孟浩巍 回复了问题 2018-09-24 16:14

测序原理 生信入门

问答 新人求教关于测序以及免疫的问题

孟浩巍: 简单来说吧，genome绝大多数的区域是非gene区，gene的绝大多数是intron，少数是exon（外显子）。   而对于一些疾病来说，绝大多数情况下是exon的突变造成的。因此对于这种情况下，如果进行全genome的测序，就会浪费很多测序量，很多时候只测exon就行了，这就是外显子组测序的优势...

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孟浩巍 回复了问题 2018-09-24 13:20

小白

问答 请问一下大家生物信息学的生物学具体应用

孟浩巍: 我建议收听一下我的知乎Live 《如何快速入门生物信息学》，里面专门讲了这个部分。   [url]https://www.zhihu.com/lives/851804180241846272[/url]

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