featureCounts assigned reads率低，正常吗？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

1: 关注

1263: 浏览

featureCounts assigned reads率低，正常吗？

RNA_Seq定量

如图，这是基因组及测序数据都是人的，STAR的比对率都是75%以上的，在进行featureCounts定量的时候，发现assigned reads 数很低，都在5%-8%之间，这正常吗？感觉有点问题，但不知道问题出在哪 [attach]79[/attach]

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

agct 注册会员用户来自于: 广东省广州市
2018-09-02 10:01

[attach]80[/attach] 命令参数是这样

赞同 0 0评论

关于作者

: agct 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

1: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-02 09:54

更新时间: 2018-09-02 10:01

关注人数: 1 人关注

相关问题

ChIP-seq的IP的比对率低的可能原因: 1225 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？: 797 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

reads数越多，滑窗内GC含量降低: 712 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因: 946 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图: 688 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗: 987 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

reads比对的统计: 626 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads: 650 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024