该问题已被锁定!
2
关注
1147
浏览

conda 配置问题

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
Bioinfotec 初级会员 用户来自于: 北京市
2023-07-07 16:54

~/.condarc是一个配置文件,可用在里面存储自定义的下载源的地址、代理设置、环境目录等信息,而conda config是一个命令,其实也就是在对condarc这个文件里面的内容进行修改,只不过是通过命令行的形式。

至于你所说的conda config --show channels,它输出的是当前所应用的通道,也就是在安装包的时候,指示conda哪些下载源去搜寻。

你输出的结果,说明目前使用了默认的通道,而你所在的配置文件中有对默认通道进行修改:

default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2

因此,实际上,下载的包时候还是从你上述下载源中获取。

你可以在下载之前使用

conda info

来查看这个包的具体信息,包括下载的url信息。

chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-07-05 20:42
conda config命令用于配置conda的各种设置,而~/.condarc文件是conda的配置文件。当我们使用conda config命令修改配置时,其实是在修改~/.condarc文件中的相应配置项。 在你的例子中,你在~/.condarc文件中添加了一些channels和custom_channels的配置,但是当你使用conda config --show channels命令查看时,结果却只显示了默认的channels配置。这是因为~/.condarc文件中的配置项会覆盖默认的配置项。具体来说,channels配置项是一个列表,当你在~/.condarc文件中重新定义channels时,它会完全替换默认的channels配置,而不是合并两者。 如果你想同时保留默认的channels配置和自定义的channels配置,可以使用如下方式修改~/.condarc文件: ```html channels: - defaults - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2 custom_channels: conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud pytorch-lts: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud ``` 这样修改后,再使用conda config --show channels命令查看,就会同时显示默认的channels和你自定义的channels。 希望这个回答能够解决你的问题!

问题动态

发布时间
2023-07-05 20:34
更新时间
2023-07-07 17:10
关注人数
2 人关注

相关问题

关于hub基因的问题
基因表达芯片的分类问题
用pbs作业系统提交作业,发现激活conda环境失败
在用seurat做多样本整合的时候的问题
CMAP LINCS 2020下载问题
conda 安装成功 但创立独立环境报错
关于ggplot2画条图的问题
多个处理组的RNAseq分析中关于counts表格合并的问题
ubuntu R 安装包路径配置
使用bedtools提取序列时的deyond length问题;bed负值

推荐内容

conda频道配置
请问一下,使用conda install deeptools之后,出现如下报错,如何解决呢?
conda 安装成功 但创立独立环境报错
conda安装mamba问题
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024