vContact2安装问题

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生信报错

安装vContact2软件成功后，运行出现报错：

vcontact2
Traceback (most recent call last):
File "/home/shpc_101737/miniconda3/bin/vcontact2", line 33, in <module>
import vcontact2.exports.summaries
File "/home/shpc_101737/miniconda3/lib/python3.9/site-packages/vcontact2/exports/summaries.py", line 11, in <module>
np.warnings.filterwarnings('ignore')
File "/home/shpc_101737/miniconda3/lib/python3.9/site-packages/numpy/__init__.py", line 320, in __getattr__
raise AttributeError("module {!r} has no attribute "
AttributeError: module 'numpy' has no attribute 'warnings'

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2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-05 13:45

估计就是包版本的问题。这个是个老大难的问题，有的脚本就用了某个包的某个特性。

曾经我写过一个脚本，调用了Biopython包，1.72不报错，1.73和1.71都报错。

这个没啥好办法，最好是直接问作者，然后建版本号一模一样的环境运行。

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-03 21:24

根据错误提示，vContact2运行时缺少numpy模块的warnings属性，导致程序运行出错。

解决方法如下：

检查是否安装了numpy模块，如果没有安装，需要先安装numpy模块。
如果已经安装了numpy模块，可以尝试升级numpy模块到最新版。
如果升级numpy模块还是无法解决问题，可以尝试修改代码，将对numpy模块warnings属性的调用改为对warnings模块的调用。

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这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2023-06-03 21:19

更新时间: 2023-06-05 13:45

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