调用micromamba 安装好的软件却发生报错

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调用micromamba 安装好的软件却发生报错

生信报错

使用micromamba安装的mlst软件，正常安装，但是调用的时候发生如下错误：

Can't locate Exporter/Tiny.pm in @INC (you may need to install the Exporter::Tiny module) (@INC contains: /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/5.32/site_perl /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/site_perl /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/5.32/vendor_perl /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/vendor_perl /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/5.32/core_perl /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/core_perl .) at /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/site_perl/List/MoreUtils.pm line 24.
BEGIN failed--compilation aborted at /home/shpc_101737/miniconda3/lib/perl5/site_perl/List/MoreUtils.pm line 24.
Compilation failed in require at /home/shpc_101737/miniconda3/bin/mlst line 7.
BEGIN failed--compilation aborted at /home/shpc_101737/miniconda3/bin/mlst line 7.

我搜了下好多解决方案，都需要sudo命令，可我不是管理员，该怎么解决呢？

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2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-02 17:29

截止到2023年6月2日，通过我详细比较conda，mamba，micromamba以后。我的建议如下：

暂时还不使用micromamba；
使用conda 3.10版本，安装以后在base环境中安装mamba；
在安装mamba以后，不再在conda的base环境中安装任何包；
所有需要的分析，全部都通过mamba创建新的环境进行软件安装。

供参考。

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-01 22:32

您好，可以尝试使用local::lib来安装Export::Tiny模块，具体步骤如下： 1. 使用micromamba安装local::lib模块： ```bash micromamba install -y perl-local-lib ``` 2. 设置PERL5LIB环境变量： ```bash eval "$(perl -I$HOME/perl5/lib/perl5 -Mlocal::lib)" ``` 3. 使用cpanm安装Export::Tiny模块： ```bash cpanm Export::Tiny ``` 4. 再次调用mlst软件，看看是否已经解决问题。注意：以上命令均为在普通用户权限下执行，不需要sudo命令。希望能够帮到您，如有疑问请随时追问。

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发布时间: 2023-06-01 22:23

更新时间: 2023-06-02 17:29

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