使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值

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使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错

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当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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三代测序使用进行gmap比对

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bowtie2使用报错，求助啦

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ASR祖先序列重建，最后一步使用PAML时出现一些问题

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使用fastp软件对fastq文件质控的问题

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问 ATAC-seq不同测序量样本的差异比较

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问 关于生存分析的问题

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问 尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰

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问 ATAC-seq与RNA-seq的联合分析

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问 sc-ATAC数据质控

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问 非靶向代谢组数据的PLS/OPLS模型Q2小于0.5，模型还可用吗？

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问 chipseq分析，利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 chipseq原始文件fastq如何截取DNA长度小于等于260bp进行后续mapping

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问 复现

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