样本批次问题

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不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）

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smart-seq2样本质检报告说有小片段，请问那还可以建库么？

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在用seurat做多样本整合的时候的问题

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麻烦问下，转录组差异分析，我需要筛掉比对率低的bam文件或者外显子比对率的样本吗

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gbff格式转为gff格式。合并的gff格式需要分开

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根据Barcode序列进行样本拆分？

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chipseq分析，利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图

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整合scRNA和scATAC相关问题请教

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在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。

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问 使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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问 scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗？

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问 运行harmony后counts数变成小数

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问 去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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问 pseudobulk分析

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问 空转bin_size

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问 单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？

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问 单细胞monocle3，路径很不对，有什么参数是值得调的吗

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