GEOquery下载GEO数据软件报错 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

1870: 浏览

GEOquery下载GEO数据软件报错

小弟我R刚入门，正在学习使用R软件GEOquery包下载数据，使用getGEO后弹出以下错误提示： Error in get0(oNam, envir = ns) : cannot open file 'C:/Users/Kumawife/Documents/R/win-library/3.5/stringi/R/stringi.rdb': No such file or directory In addition: Warning message: In get0(oNam, envir = ns) : restarting interrupted promise evaluation 虽然报错，但是仍然在目的地文件夹里面找到了一个压缩文件：GSE36552_series_matrix.txt.gz 求各位帮忙看看怎么解决~~ 谢谢大家！

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 3 个回答

minipeach 前台管理员用户来自于: 重庆市北碚区
2018-08-23 21:58

我觉得你可以尝试先设置一下工作目录，看能不能解决。

赞同 0 1评论

关于作者

: Madmax 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-23 18:57

更新时间: 2018-08-23 21:58

关注人数: 4 人关注

相关问题

SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致: 809 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

在GEO profile 下载sra文件，RunInfo Table 和accession list 有什么区别，下载哪个文件: 1089 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算: 1402 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc: 1537 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

log2后的数据进行Wilcoxon秩和检验对结果存在什么影响？: 1584 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？: 1615 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？: 1482 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Hichip得到loop数据如何注释？: 1370 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

芯片数据的批次效应对差异表达基因的计算结果影响大不大？: 1115 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果: 2136 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问生信到底如何入门？？？: 2331 浏览 6 关注 6 回答 0 评论

问 bulk-RNAseq数据集整合: 1664 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 ggtree可视化NJ树: 1225 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图: 1543 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问备份: 1004 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请大佬为我指明方向，感谢！！！: 1512 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问老孟你今答题效率逆天啊，连续几个都是你在答～: 1871 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问【求助】如何确定时期特定表达基因: 1002 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问【求助】差异表达和特异表达: 1452 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025