单细胞分析中在umap聚类（seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗？

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多种DL based的label transfer自动注释细胞类型,降维clustering两者不太匹配. 如何进行下一步的paga analysis呢?

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题

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为什么我在做go的时候，用clusterProfiler富集没有结果，但是用网站http://geneontology.org/ 做就有很多呢？代码如图

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​单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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问 降维和图的关系

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问 单细胞数据的多个lib是什么意思呢？

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问 Monocle2拟时序分支和Seurat细胞分类

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问 Harmony 和Seurat的FindIntegrationAnchors算法各有何优劣

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问 单细胞亚类聚类和相关细胞分析

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问 单细胞数据整合

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问 多种DL based的label transfer自动注释细胞类型,降维clustering两者不太匹配. 如何进行下一步的paga analysis呢?

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问 是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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