how to speed up following code - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

818: 浏览

how to speed up following code

生信问题

how to speed up following code

switch(base){
        case 'A':
            return 0;
        case 'T':
            return 1;
        case 'C':
            return 2;
        case 'G':
            return 3;
        default:
            return -1;
    }

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 1 个回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-05-22 20:29

为了加速以下代码，建议使用查表法（Look-up Table，LUT）来代替switch case语句。将每个碱基与其对应的数字进行映射，可以通过查表来快速找到碱基所对应的数字。以下是一个示例代码： ```python # 创建查表字典 lut = { 'A': 0, 'T': 1, 'C': 2, 'G': 3 } # 定义函数，使用查表法来代替switch case语句 def base_to_num(base): return lut.get(base, -1) ``` 使用查表法可以大幅提高代码的速度，因为它可以避免在程序运行时进行判断和分支操作。同时，使用查表法还可以让代码更清晰易懂，易于维护。

赞同 0 0评论

关于作者

: Kim 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2023-05-22 20:02

更新时间: 2023-05-22 20:29

关注人数: 2 人关注

相关问题

关于Cytoscape插件ClueGO的问题: 848 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GATK和Samtools联合寻找变异: 1177 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 995 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

Identification of Missing Genes in Rice Annotation by Histone Modifications 怎么理解这段？: 706 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问cytoscape是怎么构建网络的？: 798 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

ChIP-Seq deeptools热图信号比较为啥一般不做统计检验比较？: 1290 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

deeptools对ChIP-seq可视化中bw文件的选择问题？: 913 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

samtools view筛选cellranger比对结果: 784 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

T to T测序中ONT测序起到的作用: 1623 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值: 1423 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 cellranger使用问题: 1322 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 SPSS报错: 987 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 bcl2fastq2安装问题: 1159 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值: 1423 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 bulk-RNAseq数据集整合: 1232 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 SPSS报错: 1307 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 qpAdm结果解读: 943 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？: 543 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

问关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？: 696 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 atac重复样品可视化: 870 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024