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SMRT三代测序Blasr结果coverage的分析以及可视化?
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SMRT三代测序Blasr结果coverage的分析以及可视化?
用SMRT三代测序宏基因组,把拿到的bins和目标参考基因组进行比对,用Blasr比对结束后,拿到SAM或者BAM结果之后,如何对参考基因组每个contig分别生成一个base resolution covergae map(bar/curve plot)? 如何对特定片段区域的coverage进行可视化?谢谢各位老师的解答
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孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-09-09 15:01
直接用samtools depth不行吗?算的来的不就是每个bp的coverage? 可视化的话,直接用IGV
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罗本
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-09-08 11:01
更新时间
2018-09-09 15:01
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