想要提取指定基因的行信息 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

1: 关注

858: 浏览

想要提取指定基因的行信息

生物信息学

我已经筛选出了差异表达基因，但是存在一行有很多个基因的现象，比如某一行有RPL13AP5///RPL13AP6///SNORD32A///SNORD33///SNORD34///SNORD35A///RPL13A 所以我想用shell脚本把这样的每个基因弄成一行，试了好多种办法，还是没有达到想要的效果，请问各位前辈有没有什么办法可以提供一下？

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 1 个回答

minipeach 前台管理员用户来自于: 重庆市
2018-09-03 14:05

name=`cat /home/Taoct_16/anaysis/ICM/deal/name_deal.txt` for dd in $name do grep $dd 5406.txt >> result1.txt done 这是我提取信息的脚本，其中name_deal.txt是我要提取的所有的基因的名字，5406.txt是我要从中提取的文件

赞同 0 1评论

关于作者

: minipeach 前台管理员
这家伙很懒，还没有设置简介

10: 回答

0: 文章

16: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-03 14:03

更新时间: 2018-09-03 14:06

关注人数: 1 人关注

相关问题

细菌的参考基因组下载: 929 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

基因表达芯片的分类问题: 989 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？: 1028 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何下载指定文献的原始数据？？: 834 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？: 1157 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

根据已知序列查找其第三代基因组编号: 621 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

一个cohort中，某基因count大于多少才有意义？: 483 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

获取所有基因的转录起始位点（TSS）: 1306 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

参考基因组添加外源基因序列进行比对: 1237 浏览 2 关注 5 回答 0 评论

基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？: 541 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

推荐内容

问基因本体论分析上下调基因差异: 601 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于蛋白质文件的疑问: 914 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何筛选小鼠lncRNA?: 811 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点: 812 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问翻译序列: 568 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于GO分析的问题: 764 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问生信到底如何入门？？？: 1679 浏览 6 关注 6 回答 0 评论

问关于基因对某种疾病的影响的问题: 623 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读: 824 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 infercnv运行报错: 1097 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024