首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
【求助】如何确定时期特定表达基因
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
630
浏览
【求助】如何确定时期特定表达基因
生信入门
背景:我现在有一组数据,是关于玉米不同时期的基因reads-count,我现在首先想找到每个时期的特殊的表达基因,那么我现在有两种数据,一组是最原始的count矩阵,一组是在edgeR矫正过得数据。如下图:
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
为什么被折叠?
0 个回复被折叠
1
回答
热门排序
最新排序
热门排序
只看楼主
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:52
1. 如果想要确定,每个时期特定的差异表达基因,这个要做每个case对每个case的差异表达检验。这样就能求出每个不同处理对于ctrl的差异表达gene list; 2. 对这些gene list进行进一步的分析,看看不同gene的在不同时期的表达特点。 3. 还可以做个pca,然后看pca里面解释差异最大的gene都有哪些。 4. 我比较推荐用FPKM比较,或者TPM。
阅读全文
收起全文
赞同
2
3
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
3
评论
关于作者
徐寅生
初级会员
这家伙很懒,还没有设置简介
1
回答
0
文章
10
问题
问题动态
发布时间
2018-09-02 10:44
更新时间
2018-09-02 10:52
关注人数
2 人关注
相关问题
如何筛选小鼠lncRNA?
741 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点?
690 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何在 bioinfo.info 建立第一天留下自己的名字?
2636 浏览
13 关注
13 回答
1 评论
二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算
853 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
sudo apt-get install gcc++出现如下报错该如何解决?系统是:ubuntu14 server 版
721 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?
1154 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
ciriRNA表达量如何计算?
853 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
[求助]WGCNA
529 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何获得cas9蛋白的高效低效的sgRNA
715 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
x <- x[keep.exprs,, keep.lib.sizes=FALSE] 请问一下这条命令该如何解读呢?
539 浏览
1 关注
0 回答
2 评论
推荐内容
问
申博、科研
1051 浏览
2 关注
3 回答
0 评论
问
不同测序平台的scRNAseq数据集整合(10✖️、smart-seq)
854 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
xp-ehh取top值
768 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
logistic回归、异常值
772 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
新人求教关于测序以及免疫的问题
619 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
【求助】如何确定一种基因ID的类型
1038 浏览
4 关注
2 回答
0 评论
问
在使用cutadapt出现了看不懂的报错,使用snakemake编写的代码和报错的log文件内容放在下面,希望大神解惑帮忙看看是出现了什么问题?
696 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
tsRNA测序思路求助
882 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
请大佬为我指明方向,感谢!!!
948 浏览
1 关注
2 回答
0 评论
问
xpclr的XPCLR_score的inf值应该怎么处理
842 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2024
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+