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xpclr的XPCLR_score的inf值应该怎么处理

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使用陈华老师原版的xp-clr进行xp-clr寻找选择候选基因的时候，得到的结果文件表头为chr# grid# #ofSNPs_in_window physical_pos genetic_pos XPCLR_score max_s
有些XPCLR_score值为inf，但是是有具体的snp个数的，这是为什么呢？应该在后续的时候怎么处理inf值合理呢

示例如下：
Chr01 1969 3 3945058.000000 10.138772 inf 0.000000
Chr01 1970 5 3947058.000000 10.143898 2.338653 0.005000
Chr01 1971 12 3949058.000000 10.149081 inf 0.000000
Chr01 1972 10 3951058.000000 10.154239 1.261395 0.005000
Chr01 1973 6 3953058.000000 10.159402 0.000000 0.000000

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1 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-25 16:14

XPCLR_score的inf值表示在该窗口内没有发现明显的选择信号。这种情况下，XPCLR_score被定义为正无穷大。在实际处理中，我们应该将XPCLR_score的inf值设置为一个较大的数字（例如9999），以便在后续的数据分析中能够区分这些值。另外，我们可以将XPCLR_score的inf值与其他选择候选基因的XPCLR_score值进行比较，以确定哪些基因是真正的选择信号。

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发布时间: 2023-06-25 16:09

更新时间: 2023-06-25 16:14

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