细菌的参考基因组下载 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1799: 浏览

细菌的参考基因组下载

我想下载E.coli的参考基因组，但是在ucsc和ensembl上似乎都找不到，请问我可以在哪里下载到E.coli的参考基因组呢？感谢孟叔和网友们的解答

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: 北京市
2023-06-06 08:39

您好！针对您的问题，您可以在NCBI网站上下载E.coli的参考基因组。具体步骤如下：

进入NCBI网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）。
在网站搜索框中输入“Escherichia coli”，然后点击搜索按钮。
在搜索结果页面中，选择“Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655”（或其他您需要的参考菌株），进入该菌株的信息页面。
在信息页面中，选择“NCBI Reference Sequence: NC_000913.3”（或其他您需要的参考序列），进入该序列的页面。
在该序列页面中，选择“Send to” -> “Complete Record” -> “File” -> “FASTA” -> “Create File”。
下载生成的FASTA文件，即可获得E.coli的参考基因组。

希望我的回答能够帮到您！如有疑问，欢迎继续提问。

赞同 0 0评论

关于作者

: 想搞生信的小菜鸡 注册会员
00后小萌新

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2023-06-06 08:29

更新时间: 2023-06-06 11:56

关注人数: 2 人关注

相关问题

宏基因组进行binning分析: 2559 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？: 2173 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

chip-seq数据下载有多个SRA: 2039 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何从NCBI上分别下载所有的RNA病毒和DNA病毒的序列: 2565 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢: 2101 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

噬菌体比较基因组分析流程: 1896 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

annotatePeak peak基因组注释: 2443 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Aspera数据下载报错: 2740 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

TCGA数据下载: 1414 浏览 2 关注 1 回答 2 评论

小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？: 1534 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问细菌基因组分析: 1864 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问基因组组装问题: 2110 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 PacBio纠错算法的研究: 1643 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 2042 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义: 1406 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问噬菌体比较基因组分析流程: 1896 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 EVM整合基因组注释: 1685 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思？: 1494 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问本地blast最理想的结果是什么: 2100 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问获取所有基因的转录起始位点（TSS）: 3321 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025