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如何在差异表达前消除批次效应
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如何在差异表达前消除批次效应
edgeR
批次效应
差异表达
大家好, 我目前手头有一count数据,但数据存在一个批次效应,预先消除批次效应再通过edgeR做差异表达。 想法是这样, raw counts --> remove batch effect --> new counts --> edgeR 但是用removebatcheffect()函数消除批次效应后,count就不是count了,也就不是整数了,不符合导入edgeR的要求。 求解 谢谢。
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i_thinking
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2018-08-24 11:12
可以试试deseq2
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Sugus
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-08-24 11:04
更新时间
2018-08-24 11:12
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