高度杂合变异材料的遗传变异研究采取方法讨论

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高度杂合变异材料的遗传变异研究采取方法讨论

我是作脐橙研究的，由于脐橙是无性繁殖，因此材料高度杂合。我们在田间发现了一个芽变（突变体）。是嵌合体，如何测序比对获得差异。hifi+HiC么，还是由成本更低的方法。

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-05-17 14:49

根据问题描述，高度杂合变异材料的遗传变异研究需要进行测序比对来获得差异。针对脐橙这种无性繁殖植物，可以考虑采用高通量测序技术和Hi-C技术来进行测序和比对。高通量测序技术，如hifi测序，可以高效地获取脐橙基因组序列信息，从而实现芽变体与野生型的比对，进而寻找差异点。另外，通过Hi-C技术，可以将脐橙基因组中不同区域的DNA物理上相邻，从而获取基因组的三维结构信息，进一步辅助差异点的定位。综合考虑，采用hifi+HiC这种组合方案可以更全面地了解芽变体与野生型的遗传变异情况。当然，如果成本限制比较严格的话，可以考虑采用低成本的测序技术，如Illumina测序，但需要注意获得的数据质量可能会有所降低。

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发布时间: 2023-05-17 14:43

更新时间: 2023-05-17 14:49

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