运行gatk HaplotypeCaller的时候提示没有AVX加速

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运行gatk HaplotypeCaller的时候提示没有AVX加速

GATK

cpu是支持AVX指令集的，以前运行的时候也可以正常使用。有了这个警告信息之后效率下降了一倍。有没有人知道是怎么回事 WARN PairHMM - ***WARNING: Machine does not have the AVX instruction set support needed for the accelerated AVX PairHmm. Falling back to the MUCH slower LOGLESS_CACHING implementation!

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pagu 初级会员用户来自于: 北京市
2018-10-08 15:20

平常使用gatk的时候没碰过这个命令，以为影响不大来着。运行报错的时候使用的gatk是哪个版本的？近期gatk更新的非常频繁，4.0往后已经有好多个小版本了，变化比较大，如果不是最新版的话可以先换成最新的版本试一下看能不能解决

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这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2018-10-05 14:52

更新时间: 2018-10-08 15:20

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