关于DESeq2样本聚类的问题 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

818: 浏览

关于DESeq2样本聚类的问题

DESe2

[size=13]在做DESeq2之前对样本进行聚类，一个实验组的有一个离群值，[/size][size=13]是不是离群值就不能用，需要丢弃？比如处理组有4个样本，有一个和对照聚在一个小类了，是不是这个样就不能用了？另外如图红框的样本我可不可以合并为一个组？[/size]

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

i_thinking 注册会员用户来自于: 北京市
2018-09-26 09:47

请问是同一批数据吗？有没有做过标准化？

赞同 0 1评论

问题动态

发布时间: 2018-09-25 23:56

更新时间: 2018-09-26 09:47

关注人数: 2 人关注

相关问题

关于ggplot2画条图的问题: 677 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值: 782 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图: 968 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

肿瘤样本的VAF值: 1022 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于GO分析的问题: 765 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？: 1068 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异: 679 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程: 1309 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？: 1409 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

harmony整合样本前需要分别预处理吗？: 1042 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024