关于对3dDNA产生的hic文件进行纠错的问题

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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植物基因组组装过程中如何去除质体序列

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RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）

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细菌基因组分析

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关于scrublet的使用

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多个处理组的RNAseq分析中关于counts表格合并的问题

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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问 grep 能不能指定匹配第多少列？

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问 GEOquery下载GEO数据软件报错

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问 sambamba使用

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问 3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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问 ASR祖先序列重建，最后一步使用PAML时出现一些问题

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问 非靶向代谢组数据的PLS/OPLS模型Q2小于0.5，模型还可用吗？

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问 备份

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问 cellranger使用问题

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问 不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）

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