bowtie2使用报错，求助啦 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

2131: 浏览

bowtie2使用报错，求助啦

问题求解

使用如下代码：bowtie2 -p 4 -x hg19_bowtie2/hg19 -1 C2_R1_git2_reads_1.fastq.gz -2 C2_R2_git2_reads_2.fastq.gz -S C2.sam 出现下图报错：

好问题 0 评论收藏举报

3 回答

fengling 初级会员用户来自于: 河南省郑州市
2018-09-08 11:14

内存不够?

赞同 1 0评论

海王坑前台管理员用户来自于: 北京市海淀区
2018-09-08 11:27

使用Bowtie2进行序列的比对，首先是要使用bowtie2-bulid生成参考序列的索引数据库，你的电脑在建库的时候内存不足，考虑换一台内存大的电脑或者用服务器去比对？

赞同 1 0评论

windowft 注册会员用户来自于: 广东省广州市
2018-09-09 22:07

谢谢大家，更换了内存条之后，就可以运行了，确实是电脑的内存不足

赞同 0 0评论

关于作者

: windowft 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

2: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-08 11:00

更新时间: 2018-09-09 22:07

关注人数: 3 人关注

相关问题

htseq使用出现故障: 1620 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错: 2390 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？: 2383 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

求助：R语言中rm(list=ls())的函数化方式？: 1079 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

求助GATK 说明书: 1199 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

【求助】在Ubuntu如何上网: 2934 浏览 6 关注 5 回答 0 评论

R报错: 2262 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用fastp软件对fastq文件质控的问题: 2655 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

【求助】差异表达和特异表达: 2018 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

【求助】怎么能画出子网络图: 1070 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

推荐内容

问 R进行GO时出现No gene can be mapped....: 2084 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问画heatmap出现错误提示: 1295 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

问用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图: 2322 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错: 2225 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事: 2388 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问科研/读博: 2169 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错: 2390 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）: 1933 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题: 2948 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问分析CRISPR 高通量筛选数据: 2173 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025