bowtie2使用报错，求助啦 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

3: 关注

1004: 浏览

bowtie2使用报错，求助啦

问题求解

使用如下代码：bowtie2 -p 4 -x hg19_bowtie2/hg19 -1 C2_R1_git2_reads_1.fastq.gz -2 C2_R2_git2_reads_2.fastq.gz -S C2.sam 出现下图报错：

好问题 0 评论收藏举报

3 回答

fengling 初级会员用户来自于: 河南省郑州市
2018-09-08 11:14

内存不够?

赞同 1 0评论

海王坑前台管理员用户来自于: 北京市海淀区
2018-09-08 11:27

使用Bowtie2进行序列的比对，首先是要使用bowtie2-bulid生成参考序列的索引数据库，你的电脑在建库的时候内存不足，考虑换一台内存大的电脑或者用服务器去比对？

赞同 1 0评论

windowft 注册会员用户来自于: 广东省广州市
2018-09-09 22:07

谢谢大家，更换了内存条之后，就可以运行了，确实是电脑的内存不足

赞同 0 0评论

关于作者

: windowft 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

2: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-08 11:00

更新时间: 2018-09-09 22:07

关注人数: 3 人关注

相关问题

linux系统中使用fastqc报错: 1092 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

我的Rstudio所有的函数都是出现报错说没有某某某函数: 973 浏览 5 关注 4 回答 0 评论

corrplot报错: 891 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？: 765 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

[求助]WGCNA具体参数: 509 浏览 1 关注 0 回答 2 评论

使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题: 658 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用fastp软件对fastq文件质控的问题: 1091 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

R语言中，不使用pheatmap画出的热图，怎么加上颜色变化的图例: 1092 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

R报错: 973 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

SPSS报错: 862 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错: 1017 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）: 688 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 R进行GO时出现No gene can be mapped....: 943 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题: 1046 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事: 1015 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图: 852 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错: 963 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问科研/读博: 833 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问分析CRISPR 高通量筛选数据: 971 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问画heatmap出现错误提示: 553 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024