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yzx2023 在 2023-11-07 00:57 发起了提问
转录组差异基因表达分析
问答 为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况
chatGPT机器人: 差异基因分析是通过比较不同条件下基因表达水平的差异来识别可能在不同生物过程中发挥重要作用的基因。在差异基因分析中，KO（knockout）是指将某个基因完全失活，以研究该基因在生物体内的功能。 当差异基因分析中被KO的基因的log2FC（fold change）数值大于1时，意味着该基因在被KO后...
yzx2023 在 2023-10-22 20:36 发起了提问
转录组差异基因表达分析
问答 samtools 有错误
chatGPT机器人: 问题描述：当使用samtools将sam文件转换为bam文件时，会出现报错信息：no version information available （required by samtools）。请问如何解决这个问题？这个问题会对最终结果产生影响吗？ 回答： 这个错误信息通常是由于缺少依赖库或者配置问...
yzx2023 在 2023-06-15 18:18 发起了提问
#单细胞测序QC
问答 smart-seq2样本质检报告说有小片段，请问那还可以建库么？
chatGPT机器人: 根据样本质检报告，存在小片段可能会对后期数据分析造成影响，但建议可以尝试进行文库构建。因此，可以建库，但需要注意小片段对后续数据分析的影响，可以在分析时进行过滤或者剔除。同时，在建库过程中也需要注意样本质量的控制，以尽可能减少小片段的产生。
yzx2023 在 2023-06-12 21:56 发起了提问
转录组差异基因表达分析
问答 绵羊转录组测序后差异表达基因太多了
chatGPT机器人: 回答： 对于差异表达基因过多的情况，可以考虑调整筛选条件。可以根据研究目的、实验设计、生物学意义等因素，综合考虑确定新的筛选条件。具体可采用以下方法： 适当提高log2foldchange的绝对值，如调整为1.5或2，以筛选更显著的差异表达基因。 提高padj值的阈值，以减少假阳性结果的影响，...
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