孟浩巍 超级管理员

先把生信坑能做够10年！
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孟浩巍 在 2018-08-23 17:21 回答了问题
问题求解 FASTQC
使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错
孟浩巍: 是这样，因为每个reads真正测出来的adapter的长度是不同的，因此去掉adapter以后剩下的序列长度也就不同了。 FastQC这个软件，当你的reads长度范围超过一定的时候都会报错，问题不大。   如果想要弄成长度一样的序列，可以考虑使用[size=14]fastx_trimmer 或者是...
孟浩巍 在 2018-08-23 15:52 回答了问题
生信入门
在使用cutadapt出现了看不懂的报错，使用snakemake编写的代码和报错的log文件内容放在下面，希望大神解惑帮忙看看是出现了什么问题？
孟浩巍: 从报错的角度来说，是压缩文件解压缩的时候报错。 一般出现这个问题，是文件完整性的问题，建议检查文件的MD5， 如果是gz格式压缩的文件，可以使用： [code]gzip -t filename.gz [/code]来检测文件的压缩是不是有问题。
孟浩巍 在 2018-08-23 14:45 回答了问题
芯片数据分析
请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？
孟浩巍: 芯片数据分析，大概可以分成这么几个步骤： [attach]10[/attach] 分别是背景矫正（background correction） -> 归一化（normalization） -> 合并探针 （summarization）   每一步的算法最常用的如下： [attach]11[/a...
孟浩巍 在 2018-08-23 14:43 回答了问题
问题求解 GO分析 R
R进行GO时出现No gene can be mapped....
孟浩巍: 是不是你的gene_id 没有设置好啊？ entrez_id是数字，SYMBOL的意思是基因名，你在进行map的时候这两个要对应。 我看你的代码，貌似一个是entrez id 一个写成SYMBOL了。
孟浩巍 在 2018-08-23 14:21 回答了问题
没事找事
墙裂建议公众号扩大点影响力
孟浩巍: 现在是内测期，成功运行1个月以后，会开始推广的。
孟浩巍 在 2018-08-23 11:32 回答了问题
Python rpy2
有没有用过python调用R程序的模块rpy2的朋友，被这玩意弄疯了
孟浩巍: 我也遇到过这个问题，可能是python版本的问题，建议用2.7试试。
孟浩巍 在 2018-08-22 23:01 回答了问题
没事找事
测试交流区
孟浩巍: 测试外部链接   [url]http://www.bioinfo.info/?/question/8[/url]
孟浩巍 在 2018-08-22 22:32 回答了问题
没事找事
如何对新建网站进行暴力测试？
孟浩巍: # 2018-03-05 阅读GTEx文档 ## 基本信息 1. 网址 ```https://www.gtexportal.org/home/``` ## GTEx Data and Analysis FAQs 1. 数据下载 * 数据下载可以通过```https://www.ncbi.nlm....
孟浩巍 在 2018-08-22 22:26 回答了问题
建设意见
希望论坛设置一个新手入门专版
孟浩巍: 我觉得你的想法非常好！我们的内容会逐步积累起来，后期还会有咱们自己的培训课程。
孟浩巍 在 2018-08-22 18:16 回答了问题
测序序列 聚类分析 算法
常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？
孟浩巍: 一般对于这种问题，主要是2种思路。第1种是基于kmmer的，就是统计kmmer出现的频率来区分序列。第2种就是直接进行多序列比对。
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