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孟浩巍
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先把生信坑能做够10年!
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孟浩巍
在 2018-08-27 15:33 回答了问题
芯片数据分析
表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询?有没有网站进行过总结?
孟浩巍
:
take this [url]http://aroma-project.org/[/url]
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孟浩巍
在 2018-08-27 12:42 回答了问题
matplotlib
Python
关于python的matplotlib绘图时自动调整文字标签位置的模块
孟浩巍
:
倒不是奇葩,主要是R太方便了……
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孟浩巍
在 2018-08-26 21:21 回答了问题
R语言
package ‘****’ is not available (for R version 3.5.1)
孟浩巍
:
[size=14]readDGE应该是edgeR这个包里的函数。[/size] [size=14]edgeR包链接:[/size] [url]http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/edgeR.html[/url] 安装方法: [...
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孟浩巍
在 2018-08-26 21:05 回答了问题
linux网络配置
【求助】在Ubuntu如何上网
孟浩巍
:
你先在终端ping 一下百度,具体命令 ping www.baidu.com 然后内容截个图
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孟浩巍
在 2018-08-25 15:15 回答了问题
R 多线程
服务器上的Rstudio 怎样调用多线程并行运算
孟浩巍
:
R的多线程比较麻烦,并不说所有的任务都可以用[size=14]parallel包来解决。[/size] [size=14]一般情况下,会把1个任务自己分成若干个小任务,然后去跑……[/size] [size=14]QAQ[/size]
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孟浩巍
在 2018-08-25 13:05 回答了问题
生信入门
亲问大家有没有chip-seq入门相关的教程?
孟浩巍
:
我觉得,ChIP-Seq最标准的流程,当然是跟着ENCODE的pipeline走咯! [url=https://www.encodeproject.org/pages/pipelines/#DNA-binding]ENCODE-ChIP-Seq处理pipeline[/url]
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孟浩巍
在 2018-08-25 13:04 回答了问题
基因组注释
为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别?
孟浩巍
:
因为两个组织注释的方法不同啊! 如果你都打开hg38,比较每一条染色体的长度和具体信息,都是完全一致的。 gene注释的话,NCBI应该是RefSeq + 部分预测, Ensembl是自己的Havana + 部分预测,方法和策略都不相同。数目的差异主要集中在lncRNA等非编码RNA的数量上。 所以...
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孟浩巍
在 2018-08-25 13:01 回答了问题
RSutdio
如何在Ubuntu 14.04 server版上安装Rstudio,并在网页上实现绘图功能?
孟浩巍
:
安装server版的Rstudio以后是通过网页访问和调用服务器资源的,可以直接画图,和本地几乎没有区别。
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孟浩巍
在 2018-08-25 13:00 回答了问题
FASTQC
软件使用
使用Trimmomatic切除接头后做FASTQC
孟浩巍
:
首先要明白什么是tile,tile是Illumina测序的时候,1条lane里面的1个小方格,而1个tile里面又有非常多的测序cluster。 这个提示的意思就是说你数据里的tile太多了,人家就不给你画每一个tile的质量分布图了。 仅此而已。
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孟浩巍
在 2018-08-24 23:15 回答了问题
电脑配置
请教一个电脑配置的问题
孟浩巍
:
建议: 1. CPU最好是8代以后的i5或者是i7,如果是本地运行R的话,主频需要高一点,最好是3.5GHz以上; 2. 内存最少16GB; 3. 硬盘一定要SSD; 4. 系统,我个人推荐黑苹果,其次是windows,最后是裸奔Linux。 以上。
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