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孟浩巍在 2018-08-29 09:58 回答了问题 测序序列 bam GC含量: reads数越多，滑窗内GC含量降低; 孟浩巍: perl代码…… pass下一题; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍在 2018-08-28 22:09 回答了问题 Gene ID转换: 关于gene id转换以及“org.Hs.eg.db"包（小剧场？）; 孟浩巍: 你现在的问题是其实是因为你的gene id前面两个字符导致的问题，假设你的table的名称为input_table, [code]# gene real gene id gene_id.fix = substr(input_table$gene_id,3,nchar(input_table$g...; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

孟浩巍在 2018-08-28 15:52 回答了问题 软件使用: 差异可变剪接分析工具--rMATS-结果分析; 孟浩巍: 我建议你先了解一下这几个表的每一列都代表什么意思。然后再学习一下怎么画sashimiplot。最后，用rMATS官方的工具先画一些sashimiplot，之后就可以看了。对了，多说一句，rMATS计算出来的表格里面，已经给出了是否显著的信息~; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍在 2018-08-28 15:50 回答了问题 Bioconductor: bioconductor的问题; 孟浩巍: [code]source("https://bioconductor.org/biocLite.R")[/code] 把www去掉试试？另外http能用就行，https有可能是对方服务器的问题。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2018-08-28 12:55 回答了问题 算法 聚类分析: Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？; 孟浩巍: closed reference: 分析的时候如果有read落不到你的reference，这种read就直接扔掉； open reference：分析的时候如果有read落不到你的reference，这种read就直接当de novo的reference来用； de nov...; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

孟浩巍在 2018-08-28 10:35 回答了问题 GO分析 无参转录组: 请问无参转录组的GO分析如何进行; 孟浩巍: 现在blast2GO商业化了，有钱可以用，挺好用的。如果没有钱的话，一般是注释GO id以后用topGO做富集分析~ 回头我专门写一个帖子讲这个事情。; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 6 回复

孟浩巍在 2018-08-27 15:54 回答了问题 Google: mac如何打开Google的网页？; 孟浩巍: 现在的google已经不能用host改了，改了也得经常换，不好用。最好的办法是自己搭1个SS服务器，自己给自己搭1个代理。成本大约是1年200块不到。; 赞同3 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

孟浩巍在 2018-08-27 15:33 回答了问题 芯片数据分析: 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？; 孟浩巍: take this [url]http://aroma-project.org/[/url]; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

孟浩巍在 2018-08-27 12:42 回答了问题 matplotlib Python: 关于python的matplotlib绘图时自动调整文字标签位置的模块; 孟浩巍: 倒不是奇葩，主要是R太方便了……; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍在 2018-08-26 21:21 回答了问题 R语言: package ‘****’ is not available (for R version 3.5.1); 孟浩巍: [size=14]readDGE应该是edgeR这个包里的函数。[/size] [size=14]edgeR包链接：[/size] [url]http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/edgeR.html[/url] 安装方法： [...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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