孟浩巍的主页 - 做专业的生信问答网站

登录

孟浩巍超级管理员

先把生信坑能做够10年！

男

关注: 3 | 粉丝: 224 | 积分: 7770 | 威望: 3 | 访问: 14247

匿名用户在 2023-08-15 17:16 回答了问题 RNA_seq: GATK和Samtools联合寻找变异; 孟浩巍: 没必要，就用一个即可。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:16 回答了问题 数据处理 Chip_Seq: SRA 数据批量下载; 孟浩巍: 可以搜一下有一个parallel fastq dump的工具。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:15 回答了问题 生物信息学: 在单细胞测序中，不同组的T细胞统计检验方法; 孟浩巍: 你要比较的是什么？; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:15 回答了问题 转录组: 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？; 孟浩巍: 需要拼转录本，最好是用三代测序，直接测出来什么就是什么。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:14 回答了问题 生信分析: Picard Markduplicate; 孟浩巍: picard 是根据reads的起始和终点来判断的，比如双端测序，能确定这两条reads R1和R2的起点和终点，拥有相同起点和终点的都算dup； picard运行完输出一个matrix文件，里面有。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:13 回答了问题 转录组 转录组差异基因表达分析: 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程; 孟浩巍: 如果你是注释非常好的物种，比如人，小鼠之类的，可以不用搞stringtie流程，这个是组装参考转录组用的。如果你用的是注释不那么完善的物种，那么建议根据自己的数据跑一下stringtie，拼一下转录本。; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:12 回答了问题 数据下载: Aspera数据下载报错; 孟浩巍: 主要是看看你的秘钥的权限，别的应该没啥问题。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

匿名用户在 2023-08-15 17:10 回答了问题 生信问题: juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种？; 孟浩巍: 这个直接去查hiccup的github主页，上面有介绍。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:09 回答了问题 转录组差异基因表达分析: 转录组; 孟浩巍: 正常的，要比较具体的实验条件和样品。这个泛泛而言没有太大意义。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍在 2023-08-15 17:07 回答了问题 编程语言: linux bash编程debug; 孟浩巍: 这种为啥非得用shell难为自己，直接用python或者R不好么……; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

«
1
2
3
4
5
6
7
8
...
29
30
»

个人成就

获得 176 次赞同

被 224 人关注了

关注了 3 人

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024