笨阿牛 初级会员

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笨阿牛 在 2018-10-12 19:22 发起了提问
CDS序列的批量下载
问答 请问一下，如何根据基因名批量下载CDS区的序列？
孟浩巍: 这个问题其实用UCSC genome browser里面的table browser 工具能够非常方便地解决。   [b]第1步，打开 UCSC genome browser里面的table browser；[/b] [url=https://genome.ucsc.edu/]https://gen...
笨阿牛 在 2018-09-28 16:27 发起了提问
shell脚本学习
问答 编写shell脚本的if循环如下，结果运行的时候出现如下报错？原因是什么？ 大家学习shell变程的时候推荐哪些视频教程呢
pagu: shell里边的if控制结构，条件是用中括号 [  ] 框起来的，我改了一下可以运行： [code]num1=100 num2=200 if [ ${num1} > ${num2} ] then echo "this ${num1} is great!" else echo "thi...
笨阿牛 在 2018-09-27 16:45 发起了提问
conda 安装deeptools conda
问答 请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？
笨阿牛: 自问自答吧！ [size=14]conda clean --packages[/size] [size=14]输入上面的命令之后，再安装，居然就好了！完全摸不着头脑[/size]
笨阿牛 在 2018-09-22 16:20 发起了提问
linux 静态ip设置
问答 请问一下，如何将登陆服务器局域网的ip设置为静态的呢？
孟浩巍: 这个需要去设置你的ip地址：   1. 首先切换到目录 [code]cd /etc/sysconfig/network-scripts[/code]2. 查看里面的内容，这里面存着每个网卡对应的配置文件，比如你有两个网卡，你就有会两个文件名类似ifcfg-em1, ifcfg-em2的文件，找到你对...
笨阿牛 在 2018-09-21 16:12 发起了提问
linux下gcc+安装问题
问答 sudo apt-get install gcc++出现如下报错该如何解决？系统是：ubuntu14 server 版
孟浩巍: 我看你这个问题好久了，我帮你搜了搜。 结果应该是几个包的版本冲突了，得一个一个卸载然后重新安装，如果特别麻烦你就重装系统吧…… 笑哭  
笨阿牛 在 2018-09-18 10:01 发起了提问
sra文件解压缩
问答 双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图
孟浩巍: 可能是提交数据的时候，单端和双端测序的数据混在一起了。 建议后续分析的时候可以只用双端。
笨阿牛 在 2018-09-17 17:53 发起了提问
sra文件解压缩
问答 用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？
liuwq: sra-tools中好像有个prefetch命令，关于完整性，我认为主要还是看文件大小。
笨阿牛 在 2018-09-13 14:54 发起了提问
R数据处理
问答 请问一下，R语言环境下，如何在dataframe数据中添加一个key列呢？具体描述见正文
xiaoyingshi: 我的想法是写一个循环  比如 df
笨阿牛 在 2018-09-13 11:43 发起了提问
linux
问答 linux条件下，如何只删除文件夹
天地本无心: 还是没有get我上一条解答。   ls -F | grep "/" | tr -d "/" | while read folder; do rm -fr ${folder}; done    你把每个管道里的内容操作一下就明白了。另外，如果你想按照你的想法来的话。   可以如下操作： ls -l |...
笨阿牛 在 2018-09-13 10:46 发起了提问
shell脚本批处理问题
问答 求助一个shell脚本问题，如何批量处理下面这种情况？
天地本无心: ls -F | grep "/" | tr -d "/" | while read folder; do cd ${folder}; mv * ../; cd ../; done
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