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Pancras
在 2018-10-08 18:55 回答了问题
无参转录组
在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下,如何利用cuffdiff进行差异基因分析。
Pancras
:
没有,大佬,首先感谢您的回复。其次,我不太懂tophat-cufflinks这个流程。 [attach]299[/attach] [attach]300[/attach] 但是看这个流程,我有两个疑问: 1.我没有基因组(我是无参直接组装的 ’转录本‘),所以第一步tophat的mapping我不太...
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Pancras
在 2018-10-08 17:46 回答了问题
序列编辑
有哪些常用的有参序列拼接工具?
Pancras
:
我有个疑问,你都有参考序列了,你还拼接个啥。
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Pancras
在 2018-09-25 18:47 回答了问题
转录组差异基因表达分析
如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?
Pancras
:
那,大佬。有什么软件能利用tpm进行差异基因比较吗?,也就是基于tpm算出qval、foldchange的
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