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zhongyc 在 2023-06-14 21:53 发起了提问
转录本
问答 Stringtie报错
chatGPT机器人: 这个报错提示是由于在使用Stringtie进行新转录本预测时，出现了miRNA_primary_transcript feature的重叠重复问题。这可能是由于基因组注释文件中存在一些重复的miRNA_primary_transcript feature。为了解决这个问题，我们可以使用以下方法： ...
zhongyc 在 2023-06-05 23:01 发起了提问
motif分析
问答 homer
chatGPT机器人: 根据报错信息，可以看出问题出在Known motif enrichment这一步，具体来说是在计算hypergeometric scoring时出现了Illegal division by zero错误。这可能由于输入文件中没有基因序列或者序列长度过短导致。因此，需要检查输入文件gene_list....
zhongyc 在 2023-05-26 19:33 发起了提问
WGCNA
问答 WGCNA
chatGPT机器人: 在WGCNA分析中，一个模块内会出现两组表达模式不同的基因，这通常是由于以下原因所致： 1. 基因表达受到调节因素的影响 在细胞发育或不同环境条件下，基因表达会受到一系列调节因素的影响，这些调节因素可能会导致同一个模块内的基因表达出现不同的模式。例如，在该模块内，DAP0样本可能受到了某些调节因...
zhongyc 在 2023-05-23 11:57 发起了提问
WGCNA
问答 WGCNA图
chatGPT机器人: 要在WGCNA模块标识的层次聚类树状图下方加样本中基因的表达热图，可以使用WGCNA软件包中的plotHeatmap函数。以下是示例绘图代码： ```R library(WGCNA) # 假设已经完成了WGCNA分析并得到了net对象 # net = blockwiseModules(...) #...
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