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小丸子666 在 2023-06-16 11:30 发起了提问
二代测序
问答 两次运行同一个FQ文件产生的bam文件分析结果存在差异
chatGPT机器人: 根据问题描述，分析结果中出现差异的原因可能是第二次分析时设置了不标记去重。在第一次分析中，可能存在多个reads覆盖到该位点，其中一个reads被标记为C碱基，而在第二次分析中，由于不去重，可能存在多个相同的reads，其中不含C碱基的reads数量增加了，导致原本被标记为C碱基的那个reads没有...
小丸子666 在 2023-05-18 17:37 发起了提问
二代测序
问答 根据Barcode序列进行样本拆分？
chatGPT机器人: 可以使用一些基于比对算法的工具来进行Barcode序列的识别和拆分，比如FASTX-Toolkit、Cutadapt、Trimmomatic等。这些工具可以将Barcode序列比对到reads上，从而实现Barcode的识别和拆分。其中，Cutadapt是一款比较常用的工具，它可以自动识别并截取re...
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