pagu 初级会员

这家伙还没有留下自我介绍
保密
关注: 2    |    粉丝: 4    |    积分: 2560    |    威望: 2    |    访问: 1328
pagu 在 2018-10-08 15:20 回答了问题
运行gatk HaplotypeCaller的时候提示没有AVX加速
pagu: 平常使用gatk的时候没碰过这个命令,以为影响不大来着。 运行报错的时候使用的gatk是哪个版本的?近期gatk更新的非常频繁,4.0往后已经有好多个小版本了,变化比较大,如果不是最新版的话可以先换成最新的版本试一下看能不能解决
pagu 在 2018-09-29 00:35 回答了问题
编写shell脚本的if循环如下,结果运行的时候出现如下报错?原因是什么? 大家学习shell变程的时候推荐哪些视频教程呢
pagu: shell里边的if控制结构,条件是用中括号 [  ] 框起来的,我改了一下可以运行: [code]num1=100 num2=200 if [ ${num1} > ${num2} ] then echo "this ${num1} is great!" else echo "thi...
pagu 在 2018-09-27 20:49 回答了问题
利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事
pagu: 我在运行HyplotypeCaller的时候遇到过类似的问题,当时的问题在于: [b]bam文件中没有加样本信息[/b]   如果是DNA的测序分析数据,在使用bwa进行比对的时候可以直接用-R参数来添加这些信息 软件中的说明如下:[code]-R STRComplete read group he...
pagu 在 2018-09-14 16:07 回答了问题
perl的如何进行读取和循环的
pagu: 看外观这算是个shell+perl的混合,代码不全看不太懂,完整点兴许能分析一下
pagu 在 2018-09-11 22:20 回答了问题
求助一个shell脚本问题
pagu: 在shell里边有个命令叫做 [b]xargs[/b],处理这个问题贼好用,因为用它可以批量化的生成文本内容,和管道配合起来的话就可以很方便的写出来批量化运行的脚本。   比如我在一个文件夹里边有一堆的文件夹,我想分别把它们给打包成压缩文件,每个文件夹对应一个,写这个命令的话大概是这样:[code]...
pagu 在 2018-09-09 23:38 回答了问题
grep 能不能指定匹配第多少列?
pagu: cut -f 也可以指定列,然后管道去grep,效果相同
匿名用户 在 2018-08-28 22:36 回答了问题
使用fastp软件对fastq文件质控的问题
pagu: [code] # global trimming options -f, --trim_front1 trimming how many bases in front for read1, default is 0 (int [=0]) -t, --tri...
pagu 在 2018-08-27 21:56 回答了问题
请问哪位老铁有ADMIXTURE的软件包吗?原网址UCLA的软件下载界面访问不了
pagu: 额……神奇的我保留了一份,看一下可以用不,理论上说应该没问题,这貌似是个二进制文件,不用安装直接使用的那种
pagu 在 2018-08-27 21:51 回答了问题
Ubuntu 14.04 server,如何进行网络配置呢?
pagu: 提问的时候参考坑主的“提问正确姿势”,群公告里边应该是有的~   这个问题需要先说清楚是什么平台,什么系统,虚拟机还是直接硬盘安装的,然后才好进行后续的回复;   自己查错的话,首先得确认下自己是否能连外网,ping一下baidu试试看; 确认ok的话,考虑更换下载的源,比如你这上边下载Anacon...
pagu 在 2018-08-27 21:43 回答了问题
如何对新建网站进行暴力测试?
pagu: [attach]52[/attach]  
个人成就
获得 9 次赞同
被 4 人关注了
关注了 2 人
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024