孟浩巍 超级管理员

先把生信坑能做够10年!
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孟浩巍 在 2018-09-26 10:39 回答了问题
如何批量绘制多条折线
孟浩巍: 把数据截个图,举个例子? 你目前的问题描述不太好理解。   根据你上面的例子,我提供2个思路;   第1个思路,用plot函数画第1条线,然后剩下的用lines函数进行循环添加;   第2个思路,把表格整理成长表格,然后直接用ggplot2
孟浩巍 在 2018-09-25 15:09 回答了问题
如何利用利用TPM或者FPKM完成DESeq2完成的工作?
孟浩巍: DESeq2 是针对count设计的,TPM和FPKM不适合它。
孟浩巍 在 2018-09-25 14:20 回答了问题
pacbio的bas.h5文件转为fastq后为啥变小了?
孟浩巍: h5格式是带原始信号的,fastq只有质量值和序列信息,当然小很多。
孟浩巍 在 2018-09-24 17:35 回答了问题
R
求助,安装DESeq2遇到问题
孟浩巍: 试试在安装的时候这么安:  [code]>source("https://bioconductor.org/biocLite.R") >options(BioC_mirror="http://bioconductor.org") >biocLite("DESeq2")[/code]
孟浩巍 在 2018-09-24 16:14 回答了问题
新人求教关于测序以及免疫的问题
孟浩巍: 简单来说吧,genome绝大多数的区域是非gene区,gene的绝大多数是intron,少数是exon(外显子)。   而对于一些疾病来说,绝大多数情况下是exon的突变造成的。因此对于这种情况下,如果进行全genome的测序,就会浪费很多测序量,很多时候只测exon就行了,这就是外显子组测序的优势...
孟浩巍 在 2018-09-24 13:27 回答了问题
sudo apt-get install gcc++出现如下报错该如何解决?系统是:ubuntu14 server 版
孟浩巍: 我看你这个问题好久了,我帮你搜了搜。 结果应该是几个包的版本冲突了,得一个一个卸载然后重新安装,如果特别麻烦你就重装系统吧…… 笑哭  
孟浩巍 在 2018-09-24 13:20 回答了问题
请问一下大家生物信息学的生物学具体应用
孟浩巍: 我建议收听一下我的知乎Live 《如何快速入门生物信息学》,里面专门讲了这个部分。   [url]https://www.zhihu.com/lives/851804180241846272[/url]
孟浩巍 在 2018-09-24 13:19 回答了问题
RNA-seq,样本中存在同一基因对应不同的FPKM值
孟浩巍: 这个是有可能的,因为1个gene对应多个转录本,你看到的是每个转录本的FPKM,你看基因的FPKM应该是合并了这些结果之后的表格。
匿名用户 在 2018-09-24 13:18 回答了问题
R
关于ggplot2画条图的问题
孟浩巍: 提供一个思路,你在循环绘图的时候,获取一下bar的数目,也就是你的显著GO的结果的数目。 然后保存图片的时候,用ggsave函数,在里面设置输出的图像的长宽即可。比如bar的数目为10时,你可以设置height为10,bar数目为5的时候设置为5等等。  
孟浩巍 在 2018-09-22 20:17 回答了问题
请问一下,如何将登陆服务器局域网的ip设置为静态的呢?
孟浩巍: 这个需要去设置你的ip地址:   1. 首先切换到目录 [code]cd /etc/sysconfig/network-scripts[/code]2. 查看里面的内容,这里面存着每个网卡对应的配置文件,比如你有两个网卡,你就有会两个文件名类似ifcfg-em1, ifcfg-em2的文件,找到你对...
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