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liuyujie 在 2023-09-11 20:30 发起了提问 R语言: 问答 R语言

chatGPT机器人: 这个错误是因为你所使用的R版本与dbplyr包的版本不兼容导致的。根据错误信息，dbplyr包是使用R版本4.2.3来构建的，而你正在使用R版本4.22，这可能是导致加载dbplyr包失败的原因。要解决这个问题，你可以尝试以下几种方法： 1. 更新R版本：升级你的R版本到4.2.3或更高版本，...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-09-10 19:53 发起了提问 R语言: 问答 R语言

chatGPT机器人: 要解决这个问题，我们首先需要理解报错信息的含义。报错信息指出无法打开压缩文件'pRRophetic/DESCRIPTION'，原因可能是文件或目录不存在。这意味着在重新压缩R包之前，'pRRophetic/DESCRIPTION'文件不存在。为了解决这个问题，我们需要确保在重新压缩R包之前，'p...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-09-07 16:05 发起了提问 R语言: 问答药物预测

chatGPT机器人: 根据我的了解，对于药物预测问题，oncoPredict和pRRophetic两个工具使用的肿瘤表达矩阵文件应该是logTPM（Transcripts Per Million）数据类型。 logTPM是一种常用的基因表达量归一化方法，它可以解决不同样本之间的数量差异和基因长度差异对表达量计算的影响。...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-09-06 19:23 发起了提问 R语言: 问答 submap细节

chatGPT机器人: 在进行submap时，我们选择了特定的基因来构建输入的表达矩阵。这些基因的选择是通过一系列过滤方法来进行的。对于使用cDNA微阵列生成的log2转换比率数据，我们首先去除在超过5%样本中数值缺失的基因。然后，对于剩下的基因，我们使用k最近邻算法(ImputeMissingValues.KNN，G...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-09-05 19:47 发起了提问 R语言: 问答生信

chatGPT机器人: 在使用GenePattern - SubMap在线分析时，输入的两个数据集表达矩阵应使用logTPM（log转换的TPM）数据。这是因为logTPM能够更好地处理基因表达量的变化范围，使得数据更具可比性和可解释性。对于输入的表达矩阵，基因数量和种类没有特定的要求。然而，为了获得更准确的结果，建议...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-09-04 15:17 发起了提问 R语言: 问答生信

chatGPT机器人: 作为生物信息学家，我会回答：使用submap算法来分析聚类亚组和TIDE免疫结果的可行性是合理的。 Submap算法是一种用于比较和验证聚类结果的工具。它可以将一个数据集（例如聚类亚组）与一个参考数据集（例如TIDE免疫结果）进行比较，以评估它们之间的相似性。在这种情况下，我们可以将聚类亚...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-09-02 21:44 发起了提问 R语言: 问答生信

chatGPT机器人: 作为生物信息学家，我很高兴回答你的问题。SubMap算法是一种用于分析肿瘤治疗反应的方法，它可以帮助我们理解肿瘤细胞对药物的敏感性。下面是SubMap算法的详细步骤及代码示例：步骤1：准备数据首先，我们需要准备两个数据集：基线数据集和治疗后数据集。基线数据集包含肿瘤细胞的基因表达数据，而治疗后...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-08-31 20:36 发起了提问 R语言: 问答生信

chatGPT机器人: OncodriveCLUSTL和MutSigCV是两种常用的生物信息学工具，用于识别肿瘤驱动基因。下面是它们的异同之处： 1. 目标：OncodriveCLUSTL和MutSigCV都旨在识别在肿瘤中具有显著突变频率的基因，即肿瘤驱动基因。它们都帮助研究人员从大规模肿瘤测序数据中鉴定重要的突变事件...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-08-30 21:08 发起了提问 编程语言: 问答编程

chatGPT机器人: 为什么360解压MCR_R2014b_glnxa64_installer后，不能安装？这个问题可能由以下几个原因导致：文件损坏：如果在下载或解压过程中出现错误，可能会导致文件损坏。请尝试重新下载并解压文件，确保文件完整无损。系统兼容性：安装程序可能需要特定的操作系统或软件环境才能...; 关注问题 2  0  0 评论

liuyujie 在 2023-08-29 20:52 发起了提问 编程语言: 问答编程

chatGPT机器人: 要在Windows的cmd中运行Linux命令，您可以通过安装GnuWin32来实现。GnuWin32是一个GNU工具集合，提供了许多流行的Linux命令行工具的Windows版本。下面是详细的步骤：访问GnuWin32的官方网站： http://gnuwin32.sou...; 关注问题 2  0  0 评论

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