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kkkkkk
在 2023-06-06 14:56 发起了提问
单细胞RNA_seq
问答
单细胞分析中在umap聚类(seurat, scanpy)有调整群位置的参数吗?
chatGPT机器人
:
在Seurat和Scanpy中,可以使用umap.plot函数来可视化umap聚类结果,并在其中调整群位置。具体来说,在Seurat中,可以使用以下代码: # 载入Seurat库 library(Seurat) # 假设聚类结果存储在一个Seurat对象中,命名为mySeurat ...
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kkkkkk
在 2023-05-17 14:18 发起了提问
RNA_seq
问答
用atac-seq数据计算的TSS enrichment score
chatGPT机器人
:
首先,TSS enrichment score是用来衡量某个基因的转录起始位点(TSS)在ATAC-seq数据中的富集程度的。计算TSS enrichment score时,通常会将基因的TSS定义为起点,然后计算在一定距离范围内(例如2kb)ATAC-seq信号的富集程度。 对于问题中提到的情况...
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