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i_thinking
在 2018-10-11 16:58 回答了问题
hichip
Hichip得到loop数据如何注释?
i_thinking
:
谢谢,孟老师。
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i_thinking
在 2018-10-11 15:05 发起了提问
hichip
问答
Hichip得到loop数据如何注释?
孟浩巍
:
最常用的注释软件是homer软件里面的annotationPeaks,我建议你去看一下下面的链接。 注释的信息非常完整。 [url]http://homer.ucsd.edu/homer/ngs/annotation.html[/url]
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i_thinking
在 2018-09-27 15:04 回答了问题
生信问题
rna-seq数据校正
i_thinking
:
好的,感谢孟老师
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i_thinking
在 2018-09-26 09:49 发起了提问
生信问题
问答
rna-seq数据校正
孟浩巍
:
一般来说,不这么办,表达量特别高的gene本身的表达量用RNA-Seq衡量就不是很准;如果真的要确定是否有变化,你需要选择多个内参然后进行qPCR。以实验的结果为准。 还有一个办法是掺入spike-in,最常用的是ERCC序列。
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匿名用户
在 2018-09-26 09:47 回答了问题
DESe2
关于DESeq2样本聚类的问题
i_thinking
:
请问是同一批数据吗?有没有做过标准化?
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i_thinking
在 2018-09-20 10:27 发起了提问
homer
motif分析
问答
homer
老铁们,找完motif,如何筛选可信的motif呢?谢谢
:
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i_thinking
在 2018-09-03 18:27 发起了提问
htseq
问答
HTseq gtf文件的选择
tick
:
[url]https://www.gencodegenes.org/releases/grch37_mapped_releases.html[/url]
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i_thinking
在 2018-08-24 15:18 回答了问题
问题求解
R
heatmap
聚类分析
用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图
i_thinking
:
文章里的km应该是6.
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i_thinking
在 2018-08-24 11:12 回答了问题
edgeR
批次效应
差异表达
如何在差异表达前消除批次效应
i_thinking
:
可以试试deseq2
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