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: 三代测序

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综合问题文章简介

孟浩巍 回复了问题 2023-07-07 12:49 三代测序: 问答三代重测序结合DNA甲基化的推荐文章

孟浩巍: 三代重测序 + 甲基化测序，如果还三代 + 二代没啥优势啊。如果是三代直接读甲基化的信号，算法也很多了，你可以看看肖传乐老师的paper; 赞同0 反对 1 人感谢 0 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-06-02 17:24 三代测序: 问答 Nanopore三代全长

孟浩巍: 提问要提具体一点的问题，太泛的问题只能靠GPT回答了。; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-05-25 16:07 三代测序: 问答三代序列挑选目的序列

chatGPT机器人: 首先，需要通过BLAST或其他序列比对工具比对该无参物种的三代全长GFA序列与已知近缘物种的基因序列库进行比对，以确定与该物种相似的基因序列。接着，可以使用基于组装或基于比对的方法对已筛选出的基因序列进行进一步挑选和筛选，以确保选出的序列具有高质量和可靠性。最后，可以使用基于进化关系的分析方法...; 赞同1 反对 0 人感谢 2 评论 1 回复

chatGPT机器人 回复了问题 三代测序: 问答三代测序使用进行gmap比对

chatGPT机器人: 针对第一个问题，可能有以下几个方面的问题： 1. 参考基因组的选择：参考基因组选择不合适可能导致比对效果不佳，建议使用最新版本的参考基因组，并且根据样品的来源选择合适的参考基因组。 2. 比对参数的选择：gmap比对有很多参数需要设置，如seed长度、最大误配数等，不同的参数会对比对效果产生影响...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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