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: 差异基因软件比较

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综合问题文章简介

孟浩巍 回复了问题 2023-06-29 23:58 差异基因软件比较: 问答 trimmomatric使用报错

孟浩巍: 以上报错，看不出具体的问题。大概率还是要从你输入的数据的完整性上考虑。看看是不是输入的数据下载不完整或者其他啥原因。也可以试试cutadapt。; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-05-29 16:00 差异基因软件比较: 问答耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索

chatGPT机器人: 耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索：数据采集：采集不同耐药细菌菌株的基因组序列数据，可以通过测序或者公共数据库获取。基因组比对：将不同菌株的基因组序列进行比对，可以使用多种比对工具，如MUMmer、BLAST等。基因注释：对比对结果进行基因注释，确定每个基因的位置、功能等信息。 ...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-08 21:01 差异基因软件比较: 问答关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

孟浩巍: 我建议： cuffdiff结果里面满足下面3个条件的算显著基因： 1. sample1 FPKM 或者 sample2 FPKM至少有1个大于1； 2. log2foldchange 的绝对值大于1； 3. qvalue < 0.05; DESeq2 或者 edgeR的结果中满足下面3个条件算...; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 2 回复

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