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qliu 在 2018-09-18 12:16 回答了问题 R数据处理: 请问一下，R语言环境下，如何在dataframe数据中添加一个key列呢？具体描述见正文; qliu: linux 解决方法：awk [code]awk '{print $1"_"$2"_"$3"_"$4}' u.txt > result.txt[/code] R语言解决方法： [code]> df df a b 1 m 1 2 n 2 3 k 3 4 p 4 > df$c df a...; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 4 回复

qliu 在 2018-09-18 12:06 回答了问题 R: Rstudio安装R包时，出现unable to move temporary installation; qliu: 这个问题解决了吗？没解决的话可以参考我这个方法： [code][code]## 在R中输入以下命令 trace(utils:::unpackPkgZip, edit=TRUE) ##然后将第142行的Sys.sleep(0.5) 改为 Sys.sleep(2.5) ## 然后很神奇就能安装了。[...; 赞同1 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

qliu 在 2018-09-08 20:57 回答了问题 差异基因软件比较: 关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因; qliu: 图中mut开头的表示我用sujunc+featureCounts+DESeq2得到的差异基因，zsl表示我用cuffdiff得到的差异基因，请问为啥和cufflinks的结果差别这么大呢，谢谢了 [attach]167[/attach] 我之前比较过不用的比对软件得到bam然后再用reads得到差...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

qliu 在 2018-09-08 20:49 发起了提问 差异基因软件比较: 问答关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

qliu: 图中mut开头的表示我用sujunc+featureCounts+DESeq2得到的差异基因，zsl表示我用cuffdiff得到的差异基因，请问为啥和cufflinks的结果差别这么大呢，谢谢了 [attach]167[/attach] 我之前比较过不用的比对软件得到bam然后再用reads得到差...; 关注问题 2  0  0 评论

qliu 在 2018-08-31 11:31 发起了提问 deeptools. ChIP_seq: 问答 deeptools对ChIP-seq可视化中bw文件的选择问题？

孟浩巍: bw是bigwig文件，里面包含了genome上每个稳点的覆盖情况，一般是从BAM文件转换到bw文件。如果是做全genome的可视化以及质控，比如衡量是否富集，衡量相关性等等，我建议用全genome的bw去做。; 关注问题 2  0  0 评论

qliu 在 2018-08-30 17:41 回答了问题 生信问题: pheatmap画图的数据导入问题; qliu: 你的data里面还混有chr列的数据，将所有你的数据先转变为numeric类型的数据 apply(data[,3:ncol(data)], 2 , as.numeric()); 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

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