chatGPT机器人 回复了问题 2023-07-26 10:33

生信问题

问答 SPSS报错

chatGPT机器人: 根据你提供的错误信息，SPSS报错是因为在进行Logistic回归分析时，因变量的非缺失值不足两个。对于Logistic回归，从属值必须正好具有两个值，即二分类问题（例如是/否，成功/失败等）。 这个错误可能是由于数据问题导致的。首先，检查因变量是否有缺失值或者是否只有一个取值。如果因变量只有一个...

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-07-26 10:22

生信入门 生信问题

问答 logistic回归、异常值

chatGPT机器人: 进行logistic回归分析对原始的数据材料有以下要求： 数据应该是二分类或多分类的，因为logistic回归适用于分类问题。 数据应该是完整的，没有缺失值。 自变量可以是连续变量、离散变量或者二元变量。 需要对自变量进行标准化处理，以消除不同变量尺度的影响。 需要检查自变量之间是否存在...

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-07-19 11:58

linux GWAS

问答 虚拟机中使用GEC进行GWAS阈值矫正

chatGPT机器人: 根据报错信息，问题可能出现在PH_GWAS_result.txt文件的内容或格式上。请确保PH_GWAS_result.txt文件的内容符合GEC软件的要求。 在GEC软件中，PH_GWAS_result.txt文件需要包含以下列的表头信息：chr、pos和p_value。请检查该文件是否包含这些...

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-07-14 19:36

R语言

问答 R报错

chatGPT机器人: 根据提供的错误信息，问题是在运行以下代码时出现了错误： ```R set.seed(1234) nc 1` 这个错误通常是由于`fviz_nbclust()`函数返回了长度大于1的结果而引起的。该函数期望的是一个标量值，而不是一个向量或矩阵。 可能的原因是在`NbClust()`函数中设置了...

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Bioinfotec 回复了问题 2023-07-07 16:54

conda

问答 conda 配置问题

Bioinfotec: ~/.condarc是一个配置文件，可用在里面存储自定义的下载源的地址、代理设置、环境目录等信息，而conda config是一个命令，其实也就是在对condarc这个文件里面的内容进行修改，只不过是通过命令行的形式。 至于你所说的conda config --show channels，它输出的...

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孟浩巍 回复了问题 2023-06-29 23:57

conda

问答 conda安装mamba问题

孟浩巍: mac电脑哪怕是M1芯片的，也要安装x86 conda，否则可能会出现没有包的情况； 你这个大概率是channel没设置好。

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孟浩巍 回复了问题 2023-06-29 23:56

数据处理 linux

问答 linux bam数据替换

孟浩巍: 这个操作有点奇怪，因为如果上面换了，后面的alignment内容也得换。 如果都换就直接一行一行处理按字符串替换即可。

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-29 14:07

R语言

问答 corrplot报错

chatGPT机器人: 根据你提供的问题描述，错误信息显示"corrplot"函数中的"addcol"函数找不到。这可能是由于"corrplot"包版本更新所导致的函数名称变动。为了解决这个问题，你可以尝试以下几个步骤： 1. 首先，确保你已经正确安装了最新版本的"corrplot"包。你可以使用以下代码检查并安装最新版...

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孟浩巍 回复了问题 2023-06-20 10:40

生信问题

问答 安装R包sf报错

孟浩巍: 你这个是缺GADL的库，我建议带有root权限的人去编译这个库。 下面是我编译安装的命令，供你参考。 # centos 安装GDAL # GDAL 依赖 PROJ 6，所以先安装PROJ 6 wget https://download.osgeo.org/proj/proj-6.0.0.ta...

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-01 18:11

绘图

问答 plotly.express绘制饼图

chatGPT机器人: 你可以使用Python中的plotly.express模块来实现绘制可交互的饼图，并使用Dash框架来创建交互式Web应用程序。下面是一个示例代码，可以实现你的需求：   import plotly.express as px import dash import dash_cor...

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孟浩巍 回复了问题 2023-06-14 22:11

Python

问答 python脚本

孟浩巍: 提交代码的时候，不要用markdown，要用代码插入插件。重新提交一下，我再看看。

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-13 16:04

linux

问答 Liux中gtftk closest_genes怎么使用？

chatGPT机器人: 如果你想在Linux中使用gtftk closest_genes命令，可以按照以下步骤进行： 首先，你需要安装gtftk工具包。你可以使用以下命令在Linux中安装gtftk： sudo apt-get install gtftk 一旦gtftk安装完成，你就可以使用closestgenes命令。...

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-06 17:03

R

问答 ggplot绘图同时存在多个scale_fill_mamual

chatGPT机器人: 这个问题的原因是在使用ggplot绘图时，每个图层只能存在一个scalefill函数，当你尝试添加第二个scalefill_manual函数时，会替换掉之前已经存在的函数，因此你需要在绘图时添加所有的图例标题和名称，以避免出现这种错误。下面是一种可以解决该问题的解决方案： 首先，你需要创建一个包含所...

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-08 11:18

基因组

问答 修改代码：报错Error: strip arg must be None or str

chatGPT机器人: 这个问题出现的原因是strip()函数的参数必须是None或者字符串类型，而该代码中传入的参数既不是None也不是字符串类型，所以报错了。解决方法是将strip()函数的参数改为None或者字符串类型。 比如，将以下代码： ``` old_id = line.strip(None) ``` 改为：...

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chatGPT机器人 回复了问题 2023-06-06 15:31

linux

问答 有关Termius的使用

chatGPT机器人: Termius的终端界面上下移动可以使用以下两种方法： 1. 使用键盘上的Page Up和Page Down键来上下移动终端界面，类似于在文本编辑器中浏览长文本文件时的操作。 2. 在终端界面中按下Ctrl+Shift+↑或Ctrl+Shift+↓组合键，即可上下移动终端界面。 以上方法可以帮...

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