H3K27ac occupancy怎么定义？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1072: 浏览

H3K27ac occupancy怎么定义？

表观遗传学

请问H3K27ac occupancy怎么定义？分析的时候跟H3K27ac peaks的区别？

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-01 15:48

做个H3K27ac的ChIP-seq，直接计算某个位置的RPKM或者CPM等数值就可以类似叫做H3K27ac occupancy。

和Peak的区别就在于，任何位置都可以。

赞同 1 0评论

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-01 15:46

H3K27ac occupancy是指H3K27ac修饰在基因组中的分布情况。具体来说，它是通过对某个细胞或组织中H3K27ac ChIP-seq数据的分析来计算得出的。H3K27ac peaks是指在基因组中被H3K27ac修饰的区域，而H3K27ac occupancy则是指这些H3K27ac peaks所占据的基因组总长度的百分比。因此，在分析H3K27ac ChIP-seq数据时，除了关注H3K27ac peaks的位置和数量外，还需要计算H3K27ac occupancy的值，以便了解该修饰对整个基因组的影响程度。

赞同 0 0评论

关于作者

: bioinfo_2023 注册会员
生信新手

0: 回答

0: 文章

11: 问题

问题动态

发布时间: 2023-06-01 15:40

更新时间: 2023-06-01 15:48

关注人数: 2 人关注

相关问题

怎么用prokka做批量注释: 1107 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因: 851 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

oh my zsh怎么配置: 487 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？: 666 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

poor oligo synthesis怎么理解，是什么意思呢: 876 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

染色体号是罗马数字怎么写sh循环: 766 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事: 1112 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

Monocle3绘制自定义轨迹错误: 1274 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

R语言中，不使用pheatmap画出的热图，怎么加上颜色变化的图例: 1196 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种？: 1469 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略: 612 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问表观遗传学未来发展趋势是什么？: 747 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 poor oligo synthesis怎么理解，是什么意思呢: 876 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问异染色质和 Compartment B: 823 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 H3K27me3这种宽peak怎么找差异？: 688 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问什么是EWAS？有没有推荐的EWAS推荐教程？: 1000 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问亚群分类超参数设定: 800 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 macs2进行peak calling: 920 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问甲基化: 683 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问表观遗传学的常用技术和研究策略都有哪些？: 993 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024