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meme寻找大鼠的motif

motif分析

我想在命令行中使用meme-chip去寻找summit上下游200bp的motif，用的是大鼠的基因组（Rn6），使用meme-chip的时候，-db使用什么库是合适的？

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-17 10:59

你是想call motif还是怎么样？

如果是call有没有显著富集的motif直接把peak对应的区域的fasta序列提取出来，然后跑DREME即可。

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: Lancelot 注册会员
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发布时间: 2023-06-16 22:06

更新时间: 2023-06-17 10:59

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